Budući da je sjemenište odgojna ustanova Crkve, ono ima zadaću razvijati svijest sjemeništaraca o važnosti misijskog i karitativnog djelovanja kršćana. Zato svake godine uoči misijske nedjelje sjemeništarci pripremaju prigodan program zvan „misijska akademija“, koji se obično sastoji od upoznavanja nekog sveca misionara, ili svjedočanstva živućeg misionara te molitve za misionare i misijska zvanja pred Presvetim u zajedništvu sa susjedima i prijateljima sjemeništa. Osim toga, za tu prigodu sjemeništarci vlastoručno izrađuju krunice i nabožne predmete, koji se onda te večeri prodaju, a skupljeni prilog šalje se za potrebe misija. Također, u jednom kutku sjemeništa nalazi se misijska kasica, u koju sjemeništarci tijekom čitave godine mogu ubacivati novčiće, odričući se možda soka ili nekog slatkiša i čineći tako malu žrtvu ljubavi za misionare i one kojima oni služe.

Osim misijske aktivnosti, sjemeništarci subotom odlaze volontirati u pučku kuhinju sestara Misionarki ljubavi u Jukićevoj ulici u Zagrebu, ili pak u dječju bolnicu u Gornjoj Bistri. Blizak susret s osobama u potrebi ne može čovjeka ostaviti hladnim, već dotiče njegovo srce, potiče na zahvalnost i dublje promišljanje o istinskim vrijednostima života. A lijepi osjećaj u duši koji se javlja kada čovjek nešto lijepo za drugoga napravi, makar to bila sitnica, pomaže mu uvidjeti da je prava sreća u darivanju sebe drugima, po uzora na Krista, i motivirati ga da to postane stil njegova života.